1、含义不同：because释义：conj.因为。because of释义：conj.因为，由于（说明）because of是复合介词，其后可接名词、代词、动名词或由what引导的从句（但不是直接接从句）。
2、用法不同：because是从属连词，后接原因状语从句。because of是个短语介词，不可以引导原因状语从句，而应该接名词，代词等。
关于 not…because 结构：
该结构中的否定词有时否定主句，有时否定从句，一般要根据句子的意思作出正确或合乎逻辑的理解。若not否定主句，最好在because之前用逗号，否则会引起歧义，如下句在没有特定上下文时就有两种解释。如：I didnt go because I was afraid.我没有去是因为怕。不过若because之前有just修饰，一般认为not 是否定从句的。
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because和becauseof的区别 because和becauseof区别及用法：http://www.shiyongwenba.com/shiyongjingyan/2107.html